En el sector tomatero, San Juan es considerada la provincia de mayor producción y mejor rendimiento en todo el país. La superficie cultivada es de 3000 hectáreas anual, con una proyección de 2100 hectáreas. El rendimiento promedio es de 107,2 toneladas por hecárea.

Las principales zonas de cultivo en la provincia están en Pocito y Rawson. El 98% de las hectáreas cultivadas se destinan a la producción industrial y el 2% al consumo en fresco.

Además, la provincia cuenta con condiciones agroecológicas y optimización de riego en cuarteles con 195 tn de rendimiento.

El crecimiento del sector se explica por las condiciones agroecológicas, el alto porcentaje de mecanización de la cosecha en todo el ciclo de cultivo (desde la siembra, pasando por la fertilización, la aplicación de abonos foliares y pesticidas, hasta la cosecha mecánica), la optimización del recurso hídrico con el uso de la tecnología de riego por goteo, la racionalización de la fertilización mediante el sistema de "ferti-irrigación" y la integración vertical del sector a través de la Asociación Tomate 2000.

Los principales destinos de las exportaciones de tomate son: Paraguay, Brasil, Chile y Uruguay.